عم والدته السيد حسين بحر العلوم على كريمته . وللمترجم له شقيق أكبر منه اسمه السيد محمد علي استشهد المترجم له في رشت مع ولده السيد جواد في فتنة المشروطة 1021 الشيخ الميرزا محمد حسين النائيني 1277 - 1355 هو الشيخ الميرزا محمد حسين ابن شيخ الاسلام الميرزا عبد الرحيم النائيني « 1 » النجفي مجتهد خالد الذكر من أعاظم علماء الشيعة وأكابر المحققين . إن أسرة الميرزا النائيني من الأسر المعروفة في بلاده وآباؤه مشاهير هناك أيضا فقد كان والده شيخ الاسلام في عصره وكذا غيره من سلفه ، ولد المترجم له في نائين في ( 1277 ) ونشأ بها فتعلم المبادئ وبعض أوليات العلوم ، ثم هاجر إلى أصفهان فاكمل بها المقدمات ، ثم حضر في الفقه على الشيخ محمد باقر الاصفهاني ، وفي الأصول على الميرزا أبي المعالي الكلباسي ؛ وفي الحكمة والكلام على الشيخ جهانگير خان القشقائى وغيرهم ، كالشيخ محمد تقي المعروف بآغا نجفي ، والشيخ محمد حسن الهزارجريبى الشهير بالنجفى حتى نال من ذلك قسطا وافرا وحظا عظيما ، وفي ( 1303 ) هاجر إلى العراق مع السيد محمد باقر الدرجه‌إي فتشرفا معا إلى سامراء ثم ذهب السيد إلى النجف فتلمذ على الميرزا حبيب اللّه الرشتي وبقي المترجم له يحضر بحث السيد إسماعيل الصدر ؛ والسيد محمد الفشاركي الاصفهاني ، ثم أخذ بالحضور في بحث السيد المجدد الشيرازي وفي الأواخر صار كاتبا ومحررا له ولم ينقطع عن بحث الاصفهاني وبقي ملازما لبحث المجدد إلى أن توفي في ( 1312 ) واشتغل السيد الصدر المذكور بالتدريس هناك فبقى ملازما له إلى ( 1314 ) التي هاجر فيها إلى كربلاء فصحبه أيضا إليها وبقي معه عدة سنين ثم غادرها وتحول إلى النجف ، وكان الشيخ محمد كاظم الخراساني قد استقل بالتدريس على عهد السيد المجدد ولما توفي زادت تلامذته وعظم شأنه وأصبحت بين المترجم له وبينه رابطة أكيدة واختصاص وثيق ، وصار من أعوانه وأنصاره في مهماته الدينية

--> ( 1 ) نائين بلدة من نواحي يزد تبعد عنها عشرين فرسخا وتتبع في الإدارة أصفهان .